Il a pris la tête de l'agence le 21 avril 2025, remplaçant Gary Gensler, un opposant aux cryptomonnaies. Pendant ce temps, la SEC a considérablement modifié sa position concernant la réglementation et l'application des lois aux actifs numériques. Le régulateur a accéléré l'adoption des crypto-ETF et a conclu des actions en justice contre plusieurs entreprises de cryptomonnaies, y compris Binance, Coinbase, Ripple et Kraken. Sous sa direction, la SEC a également signé un mémorandum avec la CFTC pour coordonner la régulation des actifs numériques. De plus, l'agence a publié une clarification selon laquelle la plupart des cryptomonnaies ne sont pas des valeurs mobilières. La SEC a aussi envoyé à la Maison-Blanche une proposition de réglementation des cryptomonnaies. Cependant, les démocrates continuent de demander des explications à Paul Atkins au sujet du départ de Margaret Ryan. Elle dirigeait le service de l'application des lois de la SEC. On pense qu'elle a été empêchée de prendre des mesures contre les partisans de Trump, Elon Musk et Justin Sun.